Projets Jeunes Chercheurs, Jeunes Chercheuses
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Rôle et mode d’action des petits ARN bactériens dans les réseaux de régulation
Les petits ARN régulateurs (ou sRNAs) jouent un rôle clé dans l’adaptation rapide des bactéries à leur environnement. Ils contrôlent, le plus souvent au niveau post-transcriptionnel, l’expression de nombreux gènes-cibles. Au cours du projet UnifyRNA, l’étude mécanistique détaillée d’ARN régulateurs a permis de démontrer l’existence de structures secondaires situées dans la région codante de certains ARNm (messagers) et pouvant activer le démarrage de la traduction. De telles structures existent dans différents ARNm et semblent conservées chez un grand nombre de bactéries.
Il a également été trouvé que plusieurs sRNAs ciblent des ARNm codant eux-mêmes des régulateurs, transcriptionnels cette fois-ci, et appartenant à des systèmes à deux composants qui, comme les sRNAs, sont très répandus chez les bactéries et importants pour leur réponse à l’environnement. L’étude d’un de ces circuits de régulation a abouti à une observation inattendue : la régulation de différentes cibles par la forme phosphorylée ou non-phosphorylée d’un de ces régulateurs de système à deux composants.
Programme ANR : Appel à projets générique, programme JCJC
Édition, durée du projet : 2014, 48 mois
Subvention ANR : 260 000 €
Coordinatrice :
- Maude Guillier
Expression Génétique Microbienne (EGM) • CNRS Université • Paris Diderot • Institut de Biologie Physico-Chimique (IBPC)
maude.guillier@ibpc.fr
Région du projet : Île-de-France
Publication ou contribution principale :
- Brosse A., Korobeinikova A., Gottesman S. and Guillier M., 2016, Unexpected properties of sRNA promoters allow feedback control via regulation of a two-component system, Nucl. Acids Res., 44(20): 9650-9666.
- Jagodnik J., Chiaruttini C. and Guillier M., 2017, Stem-loop structures within mRNA coding sequences activate translation initiation and mediate control by small regulatory RNA, Molecular Cell, 68(1): 158-170.
Les résultats suggèrent qu’il existe de nombreuses autres connexions entre sRNAs et systèmes à deux composants, ainsi que de nombreux autres gènes dont la traduction est activée par des structures secondaires en aval du codon de démarrage. Ces études pourront être poursuivies chez une bactérie modèle comme Escherichia coli mais aussi chez d’autres bactéries, notamment des espèces pathogènes.